Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
FGD1P98174 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
FGD1P98174 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
FGD1P98174 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
FGD1P98174 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
FGD1P98174 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
FGD1P98174 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
FGD1P98174 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FGD1P98174 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
FGD1P98174 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
FGD1P98174 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FGD1P98174 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FGD1P98174 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FGD1P98174 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FGD1P98174 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
FGD1P98174 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FGD1P98174 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FGD1P98174 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
FGD1P98174 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
FGD1P98174 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
FGD1P98174 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
FGD1P98174 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FGD1P98174 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FGD1P98174 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FGD1P98174 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FGD1P98174 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FGD1P98174 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FGD1P98174 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FGD1P98174 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FGD1P98174 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FGD1P98174 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FGD1P98174 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FGD1P98174 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31■■■□□ 2.55
FGD1P98174 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
FGD1P98174 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FGD1P98174 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FGD1P98174 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FGD1P98174 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FGD1P98174 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FGD1P98174 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FGD1P98174 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FGD1P98174 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FGD1P98174 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
FGD1P98174 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
FGD1P98174 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
FGD1P98174 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
FGD1P98174 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
FGD1P98174 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FGD1P98174 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FGD1P98174 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FGD1P98174 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FGD1P98174 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FGD1P98174 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FGD1P98174 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FGD1P98174 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FGD1P98174 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FGD1P98174 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FGD1P98174 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FGD1P98174 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FGD1P98174 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FGD1P98174 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
FGD1P98174 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FGD1P98174 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FGD1P98174 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FGD1P98174 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FGD1P98174 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FGD1P98174 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FGD1P98174 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FGD1P98174 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FGD1P98174 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FGD1P98174 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FGD1P98174 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FGD1P98174 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FGD1P98174 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FGD1P98174 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FGD1P98174 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FGD1P98174 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FGD1P98174 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FGD1P98174 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FGD1P98174 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FGD1P98174 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FGD1P98174 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FGD1P98174 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FGD1P98174 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FGD1P98174 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FGD1P98174 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FGD1P98174 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FGD1P98174 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FGD1P98174 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FGD1P98174 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FGD1P98174 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FGD1P98174 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FGD1P98174 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FGD1P98174 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FGD1P98174 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FGD1P98174 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
FGD1P98174 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FGD1P98174 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FGD1P98174 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FGD1P98174 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms