Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSBP2P81877 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSBP2P81877 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSBP2P81877 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSBP2P81877 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSBP2P81877 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSBP2P81877 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSBP2P81877 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SSBP2P81877 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SSBP2P81877 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSBP2P81877 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSBP2P81877 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSBP2P81877 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSBP2P81877 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSBP2P81877 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSBP2P81877 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSBP2P81877 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSBP2P81877 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSBP2P81877 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSBP2P81877 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSBP2P81877 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSBP2P81877 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSBP2P81877 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSBP2P81877 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSBP2P81877 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSBP2P81877 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SSBP2P81877 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSBP2P81877 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSBP2P81877 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSBP2P81877 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms