Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX4P78413 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX4P78413 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX4P78413 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX4P78413 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX4P78413 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX4P78413 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX4P78413 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX4P78413 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX4P78413 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX4P78413 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX4P78413 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX4P78413 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX4P78413 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX4P78413 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX4P78413 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRX4P78413 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRX4P78413 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
IRX4P78413 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRX4P78413 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX4P78413 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX4P78413 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX4P78413 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRX4P78413 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRX4P78413 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRX4P78413 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRX4P78413 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX4P78413 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRX4P78413 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRX4P78413 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX4P78413 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX4P78413 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRX4P78413 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRX4P78413 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRX4P78413 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX4P78413 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX4P78413 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX4P78413 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX4P78413 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX4P78413 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX4P78413 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX4P78413 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX4P78413 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRX4P78413 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRX4P78413 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IRX4P78413 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRX4P78413 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRX4P78413 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX4P78413 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX4P78413 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX4P78413 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX4P78413 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX4P78413 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX4P78413 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX4P78413 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX4P78413 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX4P78413 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX4P78413 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX4P78413 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX4P78413 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX4P78413 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX4P78413 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX4P78413 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX4P78413 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX4P78413 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX4P78413 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX4P78413 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX4P78413 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX4P78413 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX4P78413 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX4P78413 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX4P78413 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX4P78413 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX4P78413 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX4P78413 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX4P78413 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX4P78413 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRX4P78413 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRX4P78413 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRX4P78413 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IRX4P78413 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IRX4P78413 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IRX4P78413 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IRX4P78413 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IRX4P78413 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IRX4P78413 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRX4P78413 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRX4P78413 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IRX4P78413 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IRX4P78413 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IRX4P78413 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IRX4P78413 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IRX4P78413 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
IRX4P78413 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
IRX4P78413 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IRX4P78413 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IRX4P78413 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IRX4P78413 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
IRX4P78413 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IRX4P78413 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms