Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRAMEP78395 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEP78395 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEP78395 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEP78395 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEP78395 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEP78395 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEP78395 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEP78395 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEP78395 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRAMEP78395 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PRAMEP78395 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEP78395 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEP78395 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEP78395 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEP78395 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEP78395 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEP78395 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEP78395 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEP78395 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEP78395 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEP78395 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEP78395 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEP78395 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEP78395 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEP78395 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEP78395 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEP78395 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRAMEP78395 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEP78395 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEP78395 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEP78395 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEP78395 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEP78395 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEP78395 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEP78395 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEP78395 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEP78395 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEP78395 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEP78395 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEP78395 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEP78395 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEP78395 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEP78395 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEP78395 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEP78395 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEP78395 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEP78395 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEP78395 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEP78395 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEP78395 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEP78395 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEP78395 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms