Protein–RNA interactions for Protein: P78330

PSPH, Phosphoserine phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPHP78330 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSPHP78330 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSPHP78330 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSPHP78330 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSPHP78330 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSPHP78330 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSPHP78330 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSPHP78330 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSPHP78330 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSPHP78330 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSPHP78330 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSPHP78330 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSPHP78330 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSPHP78330 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSPHP78330 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSPHP78330 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSPHP78330 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSPHP78330 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSPHP78330 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSPHP78330 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PSPHP78330 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSPHP78330 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PSPHP78330 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSPHP78330 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSPHP78330 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSPHP78330 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSPHP78330 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSPHP78330 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSPHP78330 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSPHP78330 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPHP78330 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSPHP78330 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSPHP78330 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSPHP78330 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSPHP78330 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSPHP78330 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSPHP78330 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PSPHP78330 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSPHP78330 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSPHP78330 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSPHP78330 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSPHP78330 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSPHP78330 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSPHP78330 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSPHP78330 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSPHP78330 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSPHP78330 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSPHP78330 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSPHP78330 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSPHP78330 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSPHP78330 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSPHP78330 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSPHP78330 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSPHP78330 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSPHP78330 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSPHP78330 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSPHP78330 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSPHP78330 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSPHP78330 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSPHP78330 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSPHP78330 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSPHP78330 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSPHP78330 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSPHP78330 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPHP78330 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPHP78330 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPHP78330 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSPHP78330 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSPHP78330 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSPHP78330 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSPHP78330 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSPHP78330 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSPHP78330 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSPHP78330 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSPHP78330 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSPHP78330 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSPHP78330 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSPHP78330 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSPHP78330 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSPHP78330 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSPHP78330 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSPHP78330 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSPHP78330 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSPHP78330 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSPHP78330 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSPHP78330 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSPHP78330 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSPHP78330 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSPHP78330 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSPHP78330 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSPHP78330 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSPHP78330 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSPHP78330 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSPHP78330 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PSPHP78330 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSPHP78330 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSPHP78330 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSPHP78330 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSPHP78330 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSPHP78330 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms