Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL11P62913 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL11P62913 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL11P62913 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL11P62913 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL11P62913 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL11P62913 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL11P62913 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL11P62913 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL11P62913 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL11P62913 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL11P62913 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL11P62913 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL11P62913 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL11P62913 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL11P62913 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL11P62913 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL11P62913 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL11P62913 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL11P62913 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL11P62913 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL11P62913 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL11P62913 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL11P62913 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL11P62913 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL11P62913 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL11P62913 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPL11P62913 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL11P62913 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL11P62913 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL11P62913 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL11P62913 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL11P62913 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL11P62913 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL11P62913 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL11P62913 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL11P62913 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL11P62913 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL11P62913 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL11P62913 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL11P62913 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL11P62913 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL11P62913 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL11P62913 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL11P62913 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL11P62913 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL11P62913 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL11P62913 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL11P62913 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL11P62913 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL11P62913 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL11P62913 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL11P62913 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL11P62913 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL11P62913 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL11P62913 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL11P62913 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL11P62913 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL11P62913 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL11P62913 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL11P62913 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL11P62913 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL11P62913 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL11P62913 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL11P62913 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL11P62913 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL11P62913 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL11P62913 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL11P62913 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL11P62913 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL11P62913 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL11P62913 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL11P62913 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL11P62913 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL11P62913 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL11P62913 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL11P62913 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL11P62913 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL11P62913 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL11P62913 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL11P62913 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL11P62913 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL11P62913 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL11P62913 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL11P62913 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL11P62913 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL11P62913 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL11P62913 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL11P62913 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL11P62913 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL11P62913 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL11P62913 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL11P62913 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL11P62913 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL11P62913 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL11P62913 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL11P62913 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL11P62913 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL11P62913 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL11P62913 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms