Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL23AP62750 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL23AP62750 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL23AP62750 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL23AP62750 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL23AP62750 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL23AP62750 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL23AP62750 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL23AP62750 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL23AP62750 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms