Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
EIF4A1P60842 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
EIF4A1P60842 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
EIF4A1P60842 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
EIF4A1P60842 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
EIF4A1P60842 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
EIF4A1P60842 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
EIF4A1P60842 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
EIF4A1P60842 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
EIF4A1P60842 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
EIF4A1P60842 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
EIF4A1P60842 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
EIF4A1P60842 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
EIF4A1P60842 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
EIF4A1P60842 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
EIF4A1P60842 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
EIF4A1P60842 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
EIF4A1P60842 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
EIF4A1P60842 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
EIF4A1P60842 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
EIF4A1P60842 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
EIF4A1P60842 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
EIF4A1P60842 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
EIF4A1P60842 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
EIF4A1P60842 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
EIF4A1P60842 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
EIF4A1P60842 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
EIF4A1P60842 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
EIF4A1P60842 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
EIF4A1P60842 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
EIF4A1P60842 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
EIF4A1P60842 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
EIF4A1P60842 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
EIF4A1P60842 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
EIF4A1P60842 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
EIF4A1P60842 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
EIF4A1P60842 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
EIF4A1P60842 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
EIF4A1P60842 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
EIF4A1P60842 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
EIF4A1P60842 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
EIF4A1P60842 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
EIF4A1P60842 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
EIF4A1P60842 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
EIF4A1P60842 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
EIF4A1P60842 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
EIF4A1P60842 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
EIF4A1P60842 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
EIF4A1P60842 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
EIF4A1P60842 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
EIF4A1P60842 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
EIF4A1P60842 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
EIF4A1P60842 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
EIF4A1P60842 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
EIF4A1P60842 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
EIF4A1P60842 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
EIF4A1P60842 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
EIF4A1P60842 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
EIF4A1P60842 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
EIF4A1P60842 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
EIF4A1P60842 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
EIF4A1P60842 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
EIF4A1P60842 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
EIF4A1P60842 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
EIF4A1P60842 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
EIF4A1P60842 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
EIF4A1P60842 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
EIF4A1P60842 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
EIF4A1P60842 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
EIF4A1P60842 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.82■■■■□ 3
EIF4A1P60842 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.81■■■■□ 3
EIF4A1P60842 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
EIF4A1P60842 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
EIF4A1P60842 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.79■■■■□ 3
EIF4A1P60842 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
EIF4A1P60842 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
EIF4A1P60842 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
EIF4A1P60842 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
EIF4A1P60842 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
EIF4A1P60842 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
EIF4A1P60842 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
EIF4A1P60842 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
EIF4A1P60842 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms