Protein–RNA interactions for Protein: P57087

JAM2, Junctional adhesion molecule B, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM2P57087 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
JAM2P57087 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
JAM2P57087 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
JAM2P57087 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
JAM2P57087 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
JAM2P57087 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
JAM2P57087 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
JAM2P57087 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
JAM2P57087 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
JAM2P57087 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
JAM2P57087 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
JAM2P57087 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
JAM2P57087 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
JAM2P57087 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
JAM2P57087 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
JAM2P57087 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
JAM2P57087 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
JAM2P57087 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
JAM2P57087 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
JAM2P57087 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
JAM2P57087 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
JAM2P57087 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
JAM2P57087 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
JAM2P57087 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
JAM2P57087 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
JAM2P57087 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
JAM2P57087 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
JAM2P57087 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
JAM2P57087 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
JAM2P57087 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
JAM2P57087 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
JAM2P57087 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
JAM2P57087 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
JAM2P57087 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
JAM2P57087 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
JAM2P57087 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
JAM2P57087 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
JAM2P57087 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
JAM2P57087 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
JAM2P57087 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
JAM2P57087 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
JAM2P57087 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
JAM2P57087 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
JAM2P57087 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
JAM2P57087 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
JAM2P57087 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
JAM2P57087 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
JAM2P57087 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
JAM2P57087 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
JAM2P57087 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
JAM2P57087 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
JAM2P57087 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
JAM2P57087 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
JAM2P57087 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
JAM2P57087 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
JAM2P57087 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
JAM2P57087 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
JAM2P57087 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
JAM2P57087 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
JAM2P57087 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
JAM2P57087 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
JAM2P57087 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
JAM2P57087 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
JAM2P57087 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
JAM2P57087 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
JAM2P57087 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
JAM2P57087 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
JAM2P57087 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
JAM2P57087 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
JAM2P57087 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
JAM2P57087 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
JAM2P57087 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
JAM2P57087 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
JAM2P57087 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
JAM2P57087 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
JAM2P57087 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
JAM2P57087 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
JAM2P57087 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
JAM2P57087 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
JAM2P57087 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
JAM2P57087 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
JAM2P57087 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
JAM2P57087 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
JAM2P57087 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
JAM2P57087 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
JAM2P57087 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
JAM2P57087 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
JAM2P57087 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
JAM2P57087 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
JAM2P57087 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
JAM2P57087 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
JAM2P57087 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
JAM2P57087 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
JAM2P57087 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
JAM2P57087 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
JAM2P57087 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
JAM2P57087 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
JAM2P57087 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
JAM2P57087 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
JAM2P57087 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms