Protein–RNA interactions for Protein: P56937

HSD17B7, 3-keto-steroid reductase, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B7P56937 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSD17B7P56937 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSD17B7P56937 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSD17B7P56937 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSD17B7P56937 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSD17B7P56937 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSD17B7P56937 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSD17B7P56937 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSD17B7P56937 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSD17B7P56937 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSD17B7P56937 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSD17B7P56937 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSD17B7P56937 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSD17B7P56937 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSD17B7P56937 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSD17B7P56937 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSD17B7P56937 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSD17B7P56937 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSD17B7P56937 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSD17B7P56937 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSD17B7P56937 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSD17B7P56937 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSD17B7P56937 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSD17B7P56937 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSD17B7P56937 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSD17B7P56937 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSD17B7P56937 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSD17B7P56937 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSD17B7P56937 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSD17B7P56937 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSD17B7P56937 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSD17B7P56937 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSD17B7P56937 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSD17B7P56937 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSD17B7P56937 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HSD17B7P56937 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSD17B7P56937 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HSD17B7P56937 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSD17B7P56937 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSD17B7P56937 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSD17B7P56937 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSD17B7P56937 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSD17B7P56937 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSD17B7P56937 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSD17B7P56937 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSD17B7P56937 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSD17B7P56937 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HSD17B7P56937 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSD17B7P56937 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSD17B7P56937 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSD17B7P56937 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSD17B7P56937 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSD17B7P56937 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSD17B7P56937 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms