Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GSCP56915 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GSCP56915 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSCP56915 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GSCP56915 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GSCP56915 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GSCP56915 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GSCP56915 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GSCP56915 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GSCP56915 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GSCP56915 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GSCP56915 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GSCP56915 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GSCP56915 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GSCP56915 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GSCP56915 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GSCP56915 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GSCP56915 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GSCP56915 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GSCP56915 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GSCP56915 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GSCP56915 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GSCP56915 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GSCP56915 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GSCP56915 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GSCP56915 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GSCP56915 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GSCP56915 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GSCP56915 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GSCP56915 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GSCP56915 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GSCP56915 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GSCP56915 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GSCP56915 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GSCP56915 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GSCP56915 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GSCP56915 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GSCP56915 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GSCP56915 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GSCP56915 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GSCP56915 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GSCP56915 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GSCP56915 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GSCP56915 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GSCP56915 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GSCP56915 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GSCP56915 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GSCP56915 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GSCP56915 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GSCP56915 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GSCP56915 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSCP56915 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSCP56915 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSCP56915 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSCP56915 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSCP56915 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GSCP56915 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GSCP56915 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GSCP56915 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GSCP56915 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GSCP56915 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GSCP56915 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GSCP56915 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GSCP56915 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GSCP56915 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GSCP56915 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GSCP56915 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GSCP56915 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GSCP56915 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GSCP56915 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GSCP56915 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GSCP56915 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GSCP56915 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GSCP56915 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GSCP56915 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GSCP56915 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GSCP56915 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GSCP56915 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GSCP56915 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GSCP56915 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GSCP56915 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GSCP56915 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GSCP56915 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GSCP56915 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GSCP56915 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GSCP56915 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSCP56915 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GSCP56915 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSCP56915 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSCP56915 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GSCP56915 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GSCP56915 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GSCP56915 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GSCP56915 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GSCP56915 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GSCP56915 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GSCP56915 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GSCP56915 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GSCP56915 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GSCP56915 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms