Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BGRP55822 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3BGRP55822 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BGRP55822 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BGRP55822 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BGRP55822 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3BGRP55822 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH3BGRP55822 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3BGRP55822 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3BGRP55822 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3BGRP55822 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3BGRP55822 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3BGRP55822 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3BGRP55822 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3BGRP55822 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3BGRP55822 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3BGRP55822 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3BGRP55822 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3BGRP55822 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3BGRP55822 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3BGRP55822 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3BGRP55822 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3BGRP55822 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3BGRP55822 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3BGRP55822 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3BGRP55822 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3BGRP55822 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3BGRP55822 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BGRP55822 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BGRP55822 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BGRP55822 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BGRP55822 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3BGRP55822 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3BGRP55822 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BGRP55822 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BGRP55822 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BGRP55822 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3BGRP55822 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3BGRP55822 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3BGRP55822 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3BGRP55822 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3BGRP55822 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3BGRP55822 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3BGRP55822 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3BGRP55822 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BGRP55822 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BGRP55822 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BGRP55822 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BGRP55822 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BGRP55822 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BGRP55822 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BGRP55822 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BGRP55822 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BGRP55822 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BGRP55822 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BGRP55822 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BGRP55822 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BGRP55822 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BGRP55822 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BGRP55822 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BGRP55822 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BGRP55822 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BGRP55822 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BGRP55822 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BGRP55822 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BGRP55822 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BGRP55822 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BGRP55822 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BGRP55822 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BGRP55822 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BGRP55822 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BGRP55822 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BGRP55822 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BGRP55822 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BGRP55822 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BGRP55822 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BGRP55822 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms