Protein–RNA interactions for Protein: P55789

GFER, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFERP55789 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GFERP55789 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GFERP55789 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GFERP55789 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GFERP55789 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GFERP55789 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GFERP55789 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GFERP55789 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GFERP55789 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GFERP55789 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GFERP55789 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GFERP55789 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GFERP55789 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GFERP55789 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GFERP55789 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GFERP55789 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GFERP55789 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GFERP55789 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GFERP55789 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GFERP55789 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GFERP55789 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GFERP55789 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GFERP55789 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GFERP55789 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GFERP55789 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GFERP55789 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GFERP55789 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GFERP55789 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GFERP55789 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GFERP55789 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GFERP55789 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GFERP55789 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GFERP55789 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GFERP55789 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GFERP55789 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GFERP55789 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GFERP55789 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GFERP55789 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GFERP55789 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GFERP55789 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GFERP55789 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GFERP55789 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GFERP55789 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GFERP55789 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GFERP55789 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GFERP55789 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GFERP55789 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GFERP55789 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GFERP55789 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GFERP55789 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GFERP55789 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GFERP55789 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GFERP55789 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GFERP55789 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFERP55789 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFERP55789 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GFERP55789 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GFERP55789 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GFERP55789 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GFERP55789 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GFERP55789 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GFERP55789 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GFERP55789 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GFERP55789 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GFERP55789 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GFERP55789 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GFERP55789 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GFERP55789 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GFERP55789 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GFERP55789 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GFERP55789 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GFERP55789 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GFERP55789 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GFERP55789 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GFERP55789 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GFERP55789 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GFERP55789 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GFERP55789 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GFERP55789 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFERP55789 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFERP55789 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFERP55789 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GFERP55789 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GFERP55789 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GFERP55789 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GFERP55789 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GFERP55789 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GFERP55789 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GFERP55789 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GFERP55789 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFERP55789 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFERP55789 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFERP55789 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFERP55789 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFERP55789 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFERP55789 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GFERP55789 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GFERP55789 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GFERP55789 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GFERP55789 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms