Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC13P55735 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC13P55735 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC13P55735 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC13P55735 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC13P55735 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC13P55735 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC13P55735 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC13P55735 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC13P55735 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC13P55735 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC13P55735 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC13P55735 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC13P55735 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC13P55735 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SEC13P55735 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC13P55735 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC13P55735 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC13P55735 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC13P55735 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC13P55735 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC13P55735 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC13P55735 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC13P55735 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC13P55735 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC13P55735 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC13P55735 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC13P55735 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC13P55735 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC13P55735 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC13P55735 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC13P55735 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC13P55735 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC13P55735 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC13P55735 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC13P55735 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC13P55735 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC13P55735 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC13P55735 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC13P55735 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC13P55735 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC13P55735 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC13P55735 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC13P55735 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC13P55735 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC13P55735 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC13P55735 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC13P55735 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC13P55735 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC13P55735 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC13P55735 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC13P55735 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC13P55735 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC13P55735 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC13P55735 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC13P55735 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC13P55735 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SEC13P55735 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEC13P55735 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEC13P55735 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEC13P55735 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC13P55735 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC13P55735 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC13P55735 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC13P55735 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC13P55735 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC13P55735 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC13P55735 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC13P55735 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC13P55735 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC13P55735 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC13P55735 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC13P55735 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC13P55735 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC13P55735 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC13P55735 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC13P55735 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC13P55735 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC13P55735 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC13P55735 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC13P55735 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC13P55735 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC13P55735 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC13P55735 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC13P55735 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC13P55735 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC13P55735 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC13P55735 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC13P55735 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC13P55735 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC13P55735 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEC13P55735 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC13P55735 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC13P55735 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC13P55735 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC13P55735 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC13P55735 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC13P55735 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC13P55735 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC13P55735 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms