Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUBP1P53384 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUBP1P53384 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUBP1P53384 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUBP1P53384 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUBP1P53384 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUBP1P53384 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUBP1P53384 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUBP1P53384 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUBP1P53384 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUBP1P53384 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUBP1P53384 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NUBP1P53384 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUBP1P53384 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUBP1P53384 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUBP1P53384 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUBP1P53384 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUBP1P53384 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUBP1P53384 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUBP1P53384 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUBP1P53384 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUBP1P53384 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUBP1P53384 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUBP1P53384 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUBP1P53384 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUBP1P53384 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUBP1P53384 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUBP1P53384 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUBP1P53384 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUBP1P53384 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUBP1P53384 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUBP1P53384 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUBP1P53384 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUBP1P53384 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUBP1P53384 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUBP1P53384 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUBP1P53384 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUBP1P53384 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUBP1P53384 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUBP1P53384 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUBP1P53384 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUBP1P53384 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUBP1P53384 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUBP1P53384 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUBP1P53384 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUBP1P53384 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUBP1P53384 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUBP1P53384 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUBP1P53384 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NUBP1P53384 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUBP1P53384 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUBP1P53384 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUBP1P53384 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NUBP1P53384 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUBP1P53384 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUBP1P53384 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUBP1P53384 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUBP1P53384 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUBP1P53384 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NUBP1P53384 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUBP1P53384 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUBP1P53384 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUBP1P53384 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUBP1P53384 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUBP1P53384 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUBP1P53384 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUBP1P53384 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUBP1P53384 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUBP1P53384 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUBP1P53384 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUBP1P53384 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUBP1P53384 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUBP1P53384 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUBP1P53384 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUBP1P53384 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUBP1P53384 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUBP1P53384 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUBP1P53384 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUBP1P53384 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUBP1P53384 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUBP1P53384 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUBP1P53384 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUBP1P53384 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUBP1P53384 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NUBP1P53384 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUBP1P53384 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUBP1P53384 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUBP1P53384 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUBP1P53384 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUBP1P53384 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUBP1P53384 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUBP1P53384 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUBP1P53384 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUBP1P53384 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUBP1P53384 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUBP1P53384 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUBP1P53384 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUBP1P53384 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUBP1P53384 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUBP1P53384 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 694.9 ms