Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAV2P52735 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAV2P52735 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VAV2P52735 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VAV2P52735 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
VAV2P52735 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAV2P52735 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAV2P52735 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VAV2P52735 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAV2P52735 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAV2P52735 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAV2P52735 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAV2P52735 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAV2P52735 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAV2P52735 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAV2P52735 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VAV2P52735 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
VAV2P52735 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
VAV2P52735 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VAV2P52735 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VAV2P52735 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VAV2P52735 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VAV2P52735 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VAV2P52735 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VAV2P52735 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VAV2P52735 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VAV2P52735 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VAV2P52735 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VAV2P52735 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VAV2P52735 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VAV2P52735 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
VAV2P52735 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VAV2P52735 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VAV2P52735 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VAV2P52735 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VAV2P52735 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VAV2P52735 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VAV2P52735 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VAV2P52735 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAV2P52735 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAV2P52735 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAV2P52735 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAV2P52735 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAV2P52735 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAV2P52735 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAV2P52735 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
VAV2P52735 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VAV2P52735 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VAV2P52735 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAV2P52735 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAV2P52735 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAV2P52735 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAV2P52735 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAV2P52735 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAV2P52735 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAV2P52735 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAV2P52735 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VAV2P52735 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VAV2P52735 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VAV2P52735 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAV2P52735 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAV2P52735 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAV2P52735 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VAV2P52735 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VAV2P52735 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VAV2P52735 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAV2P52735 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAV2P52735 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VAV2P52735 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VAV2P52735 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAV2P52735 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAV2P52735 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAV2P52735 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAV2P52735 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VAV2P52735 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
VAV2P52735 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAV2P52735 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAV2P52735 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAV2P52735 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAV2P52735 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAV2P52735 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAV2P52735 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAV2P52735 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAV2P52735 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAV2P52735 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAV2P52735 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAV2P52735 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAV2P52735 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VAV2P52735 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VAV2P52735 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VAV2P52735 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VAV2P52735 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAV2P52735 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VAV2P52735 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VAV2P52735 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAV2P52735 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAV2P52735 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAV2P52735 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAV2P52735 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAV2P52735 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms