Protein–RNA interactions for Protein: P51686

CCR9, C-C chemokine receptor type 9, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR9P51686 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR9P51686 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR9P51686 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR9P51686 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR9P51686 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR9P51686 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR9P51686 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR9P51686 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR9P51686 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR9P51686 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR9P51686 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR9P51686 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR9P51686 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR9P51686 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR9P51686 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR9P51686 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR9P51686 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR9P51686 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR9P51686 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR9P51686 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR9P51686 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR9P51686 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR9P51686 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR9P51686 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR9P51686 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR9P51686 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR9P51686 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR9P51686 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR9P51686 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR9P51686 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR9P51686 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCR9P51686 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR9P51686 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR9P51686 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR9P51686 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR9P51686 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR9P51686 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR9P51686 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR9P51686 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR9P51686 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR9P51686 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR9P51686 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR9P51686 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR9P51686 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR9P51686 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR9P51686 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR9P51686 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR9P51686 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCR9P51686 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR9P51686 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR9P51686 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR9P51686 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR9P51686 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR9P51686 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR9P51686 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR9P51686 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR9P51686 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR9P51686 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR9P51686 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR9P51686 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR9P51686 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR9P51686 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR9P51686 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR9P51686 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR9P51686 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR9P51686 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR9P51686 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR9P51686 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR9P51686 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR9P51686 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR9P51686 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR9P51686 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR9P51686 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR9P51686 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR9P51686 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR9P51686 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR9P51686 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR9P51686 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR9P51686 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR9P51686 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR9P51686 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR9P51686 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR9P51686 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR9P51686 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR9P51686 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR9P51686 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR9P51686 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR9P51686 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR9P51686 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR9P51686 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR9P51686 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR9P51686 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR9P51686 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR9P51686 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR9P51686 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR9P51686 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR9P51686 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR9P51686 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR9P51686 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR9P51686 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms