Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RORCP51449 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RORCP51449 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RORCP51449 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RORCP51449 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RORCP51449 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RORCP51449 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RORCP51449 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RORCP51449 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RORCP51449 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RORCP51449 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RORCP51449 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RORCP51449 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RORCP51449 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RORCP51449 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RORCP51449 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RORCP51449 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RORCP51449 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RORCP51449 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RORCP51449 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RORCP51449 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RORCP51449 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RORCP51449 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RORCP51449 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RORCP51449 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RORCP51449 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RORCP51449 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RORCP51449 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RORCP51449 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RORCP51449 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RORCP51449 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RORCP51449 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RORCP51449 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RORCP51449 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RORCP51449 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RORCP51449 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RORCP51449 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RORCP51449 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RORCP51449 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RORCP51449 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RORCP51449 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RORCP51449 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RORCP51449 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RORCP51449 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RORCP51449 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RORCP51449 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RORCP51449 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RORCP51449 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RORCP51449 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RORCP51449 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RORCP51449 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RORCP51449 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RORCP51449 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RORCP51449 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RORCP51449 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RORCP51449 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RORCP51449 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RORCP51449 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RORCP51449 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RORCP51449 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RORCP51449 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RORCP51449 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RORCP51449 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RORCP51449 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RORCP51449 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RORCP51449 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RORCP51449 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RORCP51449 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RORCP51449 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RORCP51449 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RORCP51449 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RORCP51449 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RORCP51449 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RORCP51449 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RORCP51449 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RORCP51449 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RORCP51449 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RORCP51449 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RORCP51449 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RORCP51449 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RORCP51449 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RORCP51449 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RORCP51449 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RORCP51449 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RORCP51449 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RORCP51449 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RORCP51449 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RORCP51449 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RORCP51449 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RORCP51449 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RORCP51449 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RORCP51449 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RORCP51449 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RORCP51449 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RORCP51449 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RORCP51449 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RORCP51449 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RORCP51449 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RORCP51449 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RORCP51449 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms