Protein–RNA interactions for Protein: P51164

ATP4B, Potassium-transporting ATPase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4BP51164 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP4BP51164 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP4BP51164 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP4BP51164 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP4BP51164 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP4BP51164 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP4BP51164 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP4BP51164 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP4BP51164 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP4BP51164 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP4BP51164 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP4BP51164 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP4BP51164 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP4BP51164 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP4BP51164 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP4BP51164 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP4BP51164 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP4BP51164 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP4BP51164 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP4BP51164 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP4BP51164 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP4BP51164 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP4BP51164 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP4BP51164 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP4BP51164 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP4BP51164 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP4BP51164 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP4BP51164 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP4BP51164 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP4BP51164 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP4BP51164 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP4BP51164 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP4BP51164 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP4BP51164 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP4BP51164 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP4BP51164 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP4BP51164 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP4BP51164 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP4BP51164 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP4BP51164 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP4BP51164 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP4BP51164 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP4BP51164 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP4BP51164 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP4BP51164 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP4BP51164 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP4BP51164 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP4BP51164 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP4BP51164 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP4BP51164 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP4BP51164 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP4BP51164 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP4BP51164 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP4BP51164 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP4BP51164 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP4BP51164 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP4BP51164 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP4BP51164 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP4BP51164 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP4BP51164 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP4BP51164 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP4BP51164 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP4BP51164 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP4BP51164 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP4BP51164 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4BP51164 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4BP51164 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4BP51164 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4BP51164 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4BP51164 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4BP51164 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4BP51164 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP4BP51164 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP4BP51164 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP4BP51164 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP4BP51164 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP4BP51164 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms