Protein–RNA interactions for Protein: P49753

ACOT2, Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOT2P49753 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ACOT2P49753 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACOT2P49753 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACOT2P49753 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACOT2P49753 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACOT2P49753 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ACOT2P49753 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACOT2P49753 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ACOT2P49753 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACOT2P49753 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ACOT2P49753 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ACOT2P49753 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACOT2P49753 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACOT2P49753 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ACOT2P49753 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACOT2P49753 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACOT2P49753 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACOT2P49753 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ACOT2P49753 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACOT2P49753 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACOT2P49753 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACOT2P49753 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ACOT2P49753 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ACOT2P49753 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ACOT2P49753 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ACOT2P49753 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACOT2P49753 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACOT2P49753 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACOT2P49753 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACOT2P49753 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACOT2P49753 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACOT2P49753 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACOT2P49753 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACOT2P49753 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ACOT2P49753 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACOT2P49753 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACOT2P49753 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACOT2P49753 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACOT2P49753 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACOT2P49753 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ACOT2P49753 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ACOT2P49753 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ACOT2P49753 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACOT2P49753 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACOT2P49753 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACOT2P49753 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACOT2P49753 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACOT2P49753 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACOT2P49753 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACOT2P49753 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACOT2P49753 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACOT2P49753 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACOT2P49753 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACOT2P49753 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACOT2P49753 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACOT2P49753 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACOT2P49753 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACOT2P49753 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACOT2P49753 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ACOT2P49753 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ACOT2P49753 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ACOT2P49753 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACOT2P49753 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACOT2P49753 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACOT2P49753 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACOT2P49753 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACOT2P49753 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACOT2P49753 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACOT2P49753 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ACOT2P49753 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACOT2P49753 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACOT2P49753 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACOT2P49753 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACOT2P49753 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACOT2P49753 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACOT2P49753 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms