Protein–RNA interactions for Protein: P49746

THBS3, Thrombospondin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3P49746 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THBS3P49746 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THBS3P49746 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THBS3P49746 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THBS3P49746 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THBS3P49746 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
THBS3P49746 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THBS3P49746 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THBS3P49746 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
THBS3P49746 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THBS3P49746 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THBS3P49746 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
THBS3P49746 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THBS3P49746 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS3P49746 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS3P49746 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS3P49746 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS3P49746 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS3P49746 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THBS3P49746 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THBS3P49746 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
THBS3P49746 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THBS3P49746 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THBS3P49746 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THBS3P49746 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THBS3P49746 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THBS3P49746 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THBS3P49746 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THBS3P49746 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THBS3P49746 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THBS3P49746 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THBS3P49746 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THBS3P49746 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THBS3P49746 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
THBS3P49746 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THBS3P49746 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THBS3P49746 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THBS3P49746 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THBS3P49746 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
THBS3P49746 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THBS3P49746 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THBS3P49746 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THBS3P49746 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THBS3P49746 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THBS3P49746 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THBS3P49746 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THBS3P49746 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THBS3P49746 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THBS3P49746 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THBS3P49746 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THBS3P49746 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THBS3P49746 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THBS3P49746 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
THBS3P49746 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THBS3P49746 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
THBS3P49746 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THBS3P49746 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THBS3P49746 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THBS3P49746 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THBS3P49746 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THBS3P49746 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THBS3P49746 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THBS3P49746 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THBS3P49746 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
THBS3P49746 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
THBS3P49746 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THBS3P49746 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THBS3P49746 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THBS3P49746 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THBS3P49746 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
THBS3P49746 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THBS3P49746 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
THBS3P49746 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
THBS3P49746 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.29■■□□□ 1
THBS3P49746 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THBS3P49746 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
THBS3P49746 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THBS3P49746 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
THBS3P49746 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
THBS3P49746 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THBS3P49746 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THBS3P49746 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
THBS3P49746 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS3P49746 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS3P49746 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS3P49746 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS3P49746 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS3P49746 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS3P49746 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS3P49746 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS3P49746 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
THBS3P49746 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THBS3P49746 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS3P49746 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS3P49746 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS3P49746 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS3P49746 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS3P49746 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
THBS3P49746 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
THBS3P49746 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 553 ms