Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB3P49720 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB3P49720 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB3P49720 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB3P49720 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB3P49720 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB3P49720 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB3P49720 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB3P49720 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB3P49720 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB3P49720 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB3P49720 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB3P49720 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB3P49720 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB3P49720 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB3P49720 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB3P49720 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PSMB3P49720 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PSMB3P49720 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB3P49720 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMB3P49720 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms