Protein–RNA interactions for Protein: P49716

CEBPD, CCAAT/enhancer-binding protein delta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPDP49716 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEBPDP49716 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEBPDP49716 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEBPDP49716 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEBPDP49716 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEBPDP49716 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEBPDP49716 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEBPDP49716 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEBPDP49716 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEBPDP49716 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEBPDP49716 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEBPDP49716 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEBPDP49716 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEBPDP49716 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEBPDP49716 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CEBPDP49716 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CEBPDP49716 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEBPDP49716 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CEBPDP49716 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEBPDP49716 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEBPDP49716 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEBPDP49716 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEBPDP49716 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEBPDP49716 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEBPDP49716 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEBPDP49716 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEBPDP49716 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEBPDP49716 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEBPDP49716 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEBPDP49716 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEBPDP49716 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CEBPDP49716 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEBPDP49716 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CEBPDP49716 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEBPDP49716 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEBPDP49716 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEBPDP49716 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CEBPDP49716 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEBPDP49716 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEBPDP49716 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEBPDP49716 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEBPDP49716 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEBPDP49716 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEBPDP49716 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEBPDP49716 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEBPDP49716 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEBPDP49716 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEBPDP49716 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEBPDP49716 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms