Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRP9P49458 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRP9P49458 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRP9P49458 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRP9P49458 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SRP9P49458 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRP9P49458 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRP9P49458 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRP9P49458 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRP9P49458 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRP9P49458 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRP9P49458 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRP9P49458 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRP9P49458 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SRP9P49458 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRP9P49458 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRP9P49458 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRP9P49458 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SRP9P49458 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRP9P49458 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRP9P49458 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRP9P49458 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP9P49458 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP9P49458 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP9P49458 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP9P49458 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP9P49458 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP9P49458 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP9P49458 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP9P49458 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP9P49458 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP9P49458 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP9P49458 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP9P49458 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP9P49458 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP9P49458 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRP9P49458 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP9P49458 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP9P49458 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP9P49458 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP9P49458 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP9P49458 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP9P49458 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP9P49458 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP9P49458 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP9P49458 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP9P49458 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP9P49458 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP9P49458 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP9P49458 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP9P49458 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP9P49458 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP9P49458 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP9P49458 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP9P49458 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP9P49458 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP9P49458 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP9P49458 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP9P49458 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP9P49458 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP9P49458 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP9P49458 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP9P49458 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRP9P49458 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP9P49458 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP9P49458 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP9P49458 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP9P49458 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP9P49458 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP9P49458 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP9P49458 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP9P49458 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP9P49458 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP9P49458 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP9P49458 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP9P49458 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP9P49458 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP9P49458 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP9P49458 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP9P49458 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP9P49458 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP9P49458 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP9P49458 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRP9P49458 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRP9P49458 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP9P49458 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP9P49458 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP9P49458 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP9P49458 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP9P49458 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP9P49458 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP9P49458 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP9P49458 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP9P49458 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP9P49458 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP9P49458 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP9P49458 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP9P49458 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP9P49458 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP9P49458 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms