Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LMAN1P49257 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LMAN1P49257 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMAN1P49257 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMAN1P49257 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
LMAN1P49257 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LMAN1P49257 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMAN1P49257 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMAN1P49257 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMAN1P49257 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMAN1P49257 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LMAN1P49257 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMAN1P49257 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMAN1P49257 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMAN1P49257 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMAN1P49257 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMAN1P49257 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LMAN1P49257 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMAN1P49257 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMAN1P49257 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMAN1P49257 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMAN1P49257 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMAN1P49257 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMAN1P49257 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMAN1P49257 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMAN1P49257 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMAN1P49257 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMAN1P49257 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMAN1P49257 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMAN1P49257 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMAN1P49257 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMAN1P49257 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMAN1P49257 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMAN1P49257 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMAN1P49257 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMAN1P49257 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMAN1P49257 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMAN1P49257 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMAN1P49257 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMAN1P49257 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMAN1P49257 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMAN1P49257 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMAN1P49257 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMAN1P49257 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMAN1P49257 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMAN1P49257 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMAN1P49257 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMAN1P49257 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMAN1P49257 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMAN1P49257 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMAN1P49257 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMAN1P49257 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMAN1P49257 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMAN1P49257 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMAN1P49257 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMAN1P49257 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMAN1P49257 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMAN1P49257 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMAN1P49257 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LMAN1P49257 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LMAN1P49257 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMAN1P49257 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LMAN1P49257 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMAN1P49257 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMAN1P49257 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMAN1P49257 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LMAN1P49257 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMAN1P49257 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMAN1P49257 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMAN1P49257 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMAN1P49257 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMAN1P49257 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMAN1P49257 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMAN1P49257 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LMAN1P49257 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMAN1P49257 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMAN1P49257 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMAN1P49257 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMAN1P49257 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms