Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP8P40818 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP8P40818 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP8P40818 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
USP8P40818 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
USP8P40818 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP8P40818 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP8P40818 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP8P40818 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP8P40818 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP8P40818 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP8P40818 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP8P40818 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP8P40818 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP8P40818 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP8P40818 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP8P40818 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP8P40818 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
USP8P40818 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
USP8P40818 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP8P40818 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP8P40818 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP8P40818 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP8P40818 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP8P40818 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP8P40818 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP8P40818 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP8P40818 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP8P40818 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP8P40818 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP8P40818 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
USP8P40818 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP8P40818 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP8P40818 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP8P40818 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP8P40818 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP8P40818 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP8P40818 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP8P40818 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP8P40818 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP8P40818 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP8P40818 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP8P40818 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP8P40818 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP8P40818 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP8P40818 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP8P40818 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP8P40818 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP8P40818 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP8P40818 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP8P40818 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP8P40818 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP8P40818 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP8P40818 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP8P40818 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP8P40818 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP8P40818 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP8P40818 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP8P40818 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP8P40818 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP8P40818 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP8P40818 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP8P40818 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP8P40818 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP8P40818 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP8P40818 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP8P40818 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP8P40818 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP8P40818 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP8P40818 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
USP8P40818 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP8P40818 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP8P40818 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP8P40818 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP8P40818 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP8P40818 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP8P40818 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP8P40818 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
USP8P40818 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP8P40818 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP8P40818 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP8P40818 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP8P40818 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP8P40818 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP8P40818 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP8P40818 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP8P40818 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP8P40818 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP8P40818 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP8P40818 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP8P40818 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP8P40818 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP8P40818 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP8P40818 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP8P40818 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP8P40818 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP8P40818 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP8P40818 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
USP8P40818 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP8P40818 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms