Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PBX1P40424 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PBX1P40424 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PBX1P40424 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PBX1P40424 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PBX1P40424 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PBX1P40424 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PBX1P40424 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PBX1P40424 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PBX1P40424 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PBX1P40424 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PBX1P40424 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PBX1P40424 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PBX1P40424 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PBX1P40424 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PBX1P40424 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PBX1P40424 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PBX1P40424 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PBX1P40424 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PBX1P40424 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PBX1P40424 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PBX1P40424 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PBX1P40424 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PBX1P40424 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PBX1P40424 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PBX1P40424 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PBX1P40424 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PBX1P40424 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PBX1P40424 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PBX1P40424 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PBX1P40424 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PBX1P40424 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PBX1P40424 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PBX1P40424 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PBX1P40424 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PBX1P40424 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PBX1P40424 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PBX1P40424 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PBX1P40424 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PBX1P40424 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBX1P40424 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBX1P40424 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PBX1P40424 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PBX1P40424 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PBX1P40424 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PBX1P40424 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PBX1P40424 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PBX1P40424 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PBX1P40424 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PBX1P40424 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PBX1P40424 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PBX1P40424 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PBX1P40424 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PBX1P40424 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PBX1P40424 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PBX1P40424 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PBX1P40424 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PBX1P40424 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PBX1P40424 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PBX1P40424 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PBX1P40424 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PBX1P40424 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PBX1P40424 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PBX1P40424 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PBX1P40424 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PBX1P40424 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PBX1P40424 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBX1P40424 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBX1P40424 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PBX1P40424 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PBX1P40424 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PBX1P40424 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PBX1P40424 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PBX1P40424 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PBX1P40424 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PBX1P40424 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PBX1P40424 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PBX1P40424 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PBX1P40424 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PBX1P40424 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PBX1P40424 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PBX1P40424 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PBX1P40424 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PBX1P40424 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PBX1P40424 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PBX1P40424 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PBX1P40424 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PBX1P40424 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PBX1P40424 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PBX1P40424 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PBX1P40424 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PBX1P40424 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PBX1P40424 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PBX1P40424 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PBX1P40424 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PBX1P40424 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PBX1P40424 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PBX1P40424 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PBX1P40424 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PBX1P40424 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 412.9 ms