Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FEN1P39748 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FEN1P39748 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FEN1P39748 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FEN1P39748 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FEN1P39748 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FEN1P39748 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FEN1P39748 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FEN1P39748 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FEN1P39748 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FEN1P39748 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FEN1P39748 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FEN1P39748 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FEN1P39748 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FEN1P39748 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FEN1P39748 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FEN1P39748 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FEN1P39748 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FEN1P39748 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FEN1P39748 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FEN1P39748 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FEN1P39748 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FEN1P39748 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FEN1P39748 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FEN1P39748 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FEN1P39748 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FEN1P39748 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FEN1P39748 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FEN1P39748 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FEN1P39748 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FEN1P39748 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FEN1P39748 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FEN1P39748 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FEN1P39748 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FEN1P39748 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FEN1P39748 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FEN1P39748 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FEN1P39748 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FEN1P39748 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FEN1P39748 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FEN1P39748 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FEN1P39748 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FEN1P39748 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FEN1P39748 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FEN1P39748 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FEN1P39748 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FEN1P39748 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FEN1P39748 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FEN1P39748 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FEN1P39748 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FEN1P39748 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FEN1P39748 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FEN1P39748 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FEN1P39748 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FEN1P39748 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FEN1P39748 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FEN1P39748 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FEN1P39748 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FEN1P39748 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FEN1P39748 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FEN1P39748 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FEN1P39748 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FEN1P39748 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FEN1P39748 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FEN1P39748 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FEN1P39748 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FEN1P39748 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FEN1P39748 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FEN1P39748 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FEN1P39748 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FEN1P39748 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FEN1P39748 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FEN1P39748 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FEN1P39748 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FEN1P39748 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FEN1P39748 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FEN1P39748 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FEN1P39748 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FEN1P39748 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FEN1P39748 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FEN1P39748 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FEN1P39748 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FEN1P39748 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FEN1P39748 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FEN1P39748 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FEN1P39748 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FEN1P39748 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FEN1P39748 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FEN1P39748 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FEN1P39748 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FEN1P39748 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FEN1P39748 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FEN1P39748 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FEN1P39748 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FEN1P39748 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FEN1P39748 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FEN1P39748 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FEN1P39748 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FEN1P39748 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FEN1P39748 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms