Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
PCK1P35558 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCK1P35558 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCK1P35558 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PCK1P35558 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCK1P35558 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCK1P35558 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCK1P35558 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCK1P35558 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCK1P35558 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCK1P35558 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCK1P35558 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCK1P35558 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCK1P35558 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCK1P35558 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCK1P35558 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCK1P35558 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCK1P35558 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCK1P35558 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCK1P35558 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCK1P35558 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCK1P35558 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCK1P35558 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PCK1P35558 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCK1P35558 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCK1P35558 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCK1P35558 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCK1P35558 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCK1P35558 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCK1P35558 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCK1P35558 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCK1P35558 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCK1P35558 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCK1P35558 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCK1P35558 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCK1P35558 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCK1P35558 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCK1P35558 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCK1P35558 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCK1P35558 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCK1P35558 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCK1P35558 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PCK1P35558 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCK1P35558 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCK1P35558 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCK1P35558 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCK1P35558 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCK1P35558 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCK1P35558 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCK1P35558 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PCK1P35558 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCK1P35558 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCK1P35558 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCK1P35558 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCK1P35558 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCK1P35558 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCK1P35558 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCK1P35558 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PCK1P35558 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCK1P35558 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCK1P35558 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCK1P35558 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCK1P35558 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCK1P35558 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCK1P35558 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCK1P35558 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCK1P35558 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCK1P35558 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCK1P35558 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCK1P35558 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCK1P35558 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCK1P35558 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PCK1P35558 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCK1P35558 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PCK1P35558 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCK1P35558 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCK1P35558 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCK1P35558 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCK1P35558 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCK1P35558 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCK1P35558 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCK1P35558 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCK1P35558 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCK1P35558 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCK1P35558 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCK1P35558 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCK1P35558 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCK1P35558 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCK1P35558 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCK1P35558 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCK1P35558 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCK1P35558 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCK1P35558 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCK1P35558 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCK1P35558 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCK1P35558 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCK1P35558 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCK1P35558 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCK1P35558 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCK1P35558 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms