Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFC1P35251 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFC1P35251 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFC1P35251 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFC1P35251 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFC1P35251 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFC1P35251 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFC1P35251 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFC1P35251 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFC1P35251 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFC1P35251 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFC1P35251 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RFC1P35251 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFC1P35251 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFC1P35251 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFC1P35251 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFC1P35251 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFC1P35251 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFC1P35251 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFC1P35251 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFC1P35251 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFC1P35251 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RFC1P35251 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFC1P35251 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFC1P35251 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFC1P35251 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFC1P35251 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFC1P35251 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RFC1P35251 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFC1P35251 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFC1P35251 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RFC1P35251 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFC1P35251 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFC1P35251 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFC1P35251 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFC1P35251 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFC1P35251 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RFC1P35251 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RFC1P35251 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFC1P35251 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFC1P35251 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFC1P35251 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFC1P35251 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFC1P35251 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RFC1P35251 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFC1P35251 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFC1P35251 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFC1P35251 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RFC1P35251 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RFC1P35251 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RFC1P35251 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFC1P35251 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFC1P35251 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFC1P35251 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFC1P35251 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFC1P35251 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFC1P35251 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFC1P35251 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFC1P35251 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFC1P35251 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFC1P35251 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFC1P35251 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFC1P35251 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFC1P35251 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFC1P35251 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RFC1P35251 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RFC1P35251 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RFC1P35251 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFC1P35251 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFC1P35251 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFC1P35251 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFC1P35251 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFC1P35251 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFC1P35251 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFC1P35251 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFC1P35251 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFC1P35251 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFC1P35251 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFC1P35251 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFC1P35251 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RFC1P35251 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFC1P35251 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFC1P35251 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFC1P35251 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFC1P35251 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFC1P35251 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFC1P35251 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFC1P35251 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFC1P35251 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFC1P35251 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFC1P35251 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFC1P35251 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFC1P35251 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFC1P35251 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFC1P35251 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFC1P35251 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFC1P35251 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFC1P35251 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFC1P35251 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RFC1P35251 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms