Protein–RNA interactions for Protein: P30838

ALDH3A1, Aldehyde dehydrogenase, dimeric NADP-preferring, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH3A1P30838 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALDH3A1P30838 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALDH3A1P30838 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALDH3A1P30838 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALDH3A1P30838 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALDH3A1P30838 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALDH3A1P30838 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALDH3A1P30838 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALDH3A1P30838 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALDH3A1P30838 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALDH3A1P30838 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALDH3A1P30838 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALDH3A1P30838 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALDH3A1P30838 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALDH3A1P30838 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALDH3A1P30838 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALDH3A1P30838 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALDH3A1P30838 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALDH3A1P30838 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALDH3A1P30838 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALDH3A1P30838 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALDH3A1P30838 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALDH3A1P30838 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALDH3A1P30838 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALDH3A1P30838 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALDH3A1P30838 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALDH3A1P30838 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALDH3A1P30838 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALDH3A1P30838 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALDH3A1P30838 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ALDH3A1P30838 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALDH3A1P30838 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ALDH3A1P30838 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALDH3A1P30838 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALDH3A1P30838 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALDH3A1P30838 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALDH3A1P30838 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALDH3A1P30838 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALDH3A1P30838 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALDH3A1P30838 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALDH3A1P30838 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALDH3A1P30838 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH3A1P30838 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH3A1P30838 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH3A1P30838 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH3A1P30838 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALDH3A1P30838 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALDH3A1P30838 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALDH3A1P30838 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALDH3A1P30838 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ALDH3A1P30838 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALDH3A1P30838 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALDH3A1P30838 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALDH3A1P30838 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALDH3A1P30838 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALDH3A1P30838 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ALDH3A1P30838 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ALDH3A1P30838 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALDH3A1P30838 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALDH3A1P30838 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALDH3A1P30838 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALDH3A1P30838 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALDH3A1P30838 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALDH3A1P30838 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALDH3A1P30838 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALDH3A1P30838 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALDH3A1P30838 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALDH3A1P30838 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALDH3A1P30838 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALDH3A1P30838 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALDH3A1P30838 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALDH3A1P30838 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALDH3A1P30838 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALDH3A1P30838 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms