Protein–RNA interactions for Protein: P30050

RPL12, 60S ribosomal protein L12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL12P30050 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL12P30050 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL12P30050 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL12P30050 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL12P30050 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL12P30050 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL12P30050 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL12P30050 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL12P30050 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL12P30050 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL12P30050 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL12P30050 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL12P30050 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL12P30050 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL12P30050 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL12P30050 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL12P30050 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL12P30050 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL12P30050 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL12P30050 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL12P30050 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL12P30050 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL12P30050 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL12P30050 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL12P30050 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL12P30050 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL12P30050 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL12P30050 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL12P30050 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL12P30050 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL12P30050 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL12P30050 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL12P30050 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL12P30050 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL12P30050 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL12P30050 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL12P30050 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL12P30050 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL12P30050 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL12P30050 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL12P30050 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL12P30050 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL12P30050 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL12P30050 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL12P30050 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL12P30050 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL12P30050 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL12P30050 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL12P30050 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL12P30050 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL12P30050 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL12P30050 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL12P30050 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL12P30050 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL12P30050 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL12P30050 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL12P30050 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL12P30050 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL12P30050 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL12P30050 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL12P30050 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL12P30050 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL12P30050 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL12P30050 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL12P30050 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL12P30050 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL12P30050 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL12P30050 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL12P30050 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL12P30050 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL12P30050 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL12P30050 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL12P30050 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL12P30050 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL12P30050 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL12P30050 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL12P30050 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL12P30050 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL12P30050 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL12P30050 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL12P30050 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL12P30050 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL12P30050 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL12P30050 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL12P30050 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL12P30050 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL12P30050 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL12P30050 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL12P30050 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL12P30050 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL12P30050 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL12P30050 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL12P30050 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL12P30050 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL12P30050 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL12P30050 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL12P30050 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL12P30050 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL12P30050 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL12P30050 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.3 ms