Protein–RNA interactions for Protein: P30040

ERP29, Endoplasmic reticulum resident protein 29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP29P30040 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ERP29P30040 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERP29P30040 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERP29P30040 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERP29P30040 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERP29P30040 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERP29P30040 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERP29P30040 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERP29P30040 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERP29P30040 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERP29P30040 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERP29P30040 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERP29P30040 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERP29P30040 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERP29P30040 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERP29P30040 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERP29P30040 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERP29P30040 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERP29P30040 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERP29P30040 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERP29P30040 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERP29P30040 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERP29P30040 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERP29P30040 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERP29P30040 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERP29P30040 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERP29P30040 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERP29P30040 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERP29P30040 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERP29P30040 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERP29P30040 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERP29P30040 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERP29P30040 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERP29P30040 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERP29P30040 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERP29P30040 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERP29P30040 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERP29P30040 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERP29P30040 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERP29P30040 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERP29P30040 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERP29P30040 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERP29P30040 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERP29P30040 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERP29P30040 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERP29P30040 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERP29P30040 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERP29P30040 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERP29P30040 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERP29P30040 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERP29P30040 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERP29P30040 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERP29P30040 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERP29P30040 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERP29P30040 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERP29P30040 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERP29P30040 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERP29P30040 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERP29P30040 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERP29P30040 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERP29P30040 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERP29P30040 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERP29P30040 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERP29P30040 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERP29P30040 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERP29P30040 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERP29P30040 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERP29P30040 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERP29P30040 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERP29P30040 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERP29P30040 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERP29P30040 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERP29P30040 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERP29P30040 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERP29P30040 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERP29P30040 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERP29P30040 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERP29P30040 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERP29P30040 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERP29P30040 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERP29P30040 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERP29P30040 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERP29P30040 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERP29P30040 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERP29P30040 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERP29P30040 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERP29P30040 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERP29P30040 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERP29P30040 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERP29P30040 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERP29P30040 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERP29P30040 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERP29P30040 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERP29P30040 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ERP29P30040 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERP29P30040 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERP29P30040 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ERP29P30040 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERP29P30040 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERP29P30040 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms