Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GJB2P29033 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GJB2P29033 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GJB2P29033 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GJB2P29033 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GJB2P29033 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GJB2P29033 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GJB2P29033 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
GJB2P29033 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GJB2P29033 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GJB2P29033 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GJB2P29033 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GJB2P29033 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GJB2P29033 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GJB2P29033 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GJB2P29033 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GJB2P29033 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GJB2P29033 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GJB2P29033 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GJB2P29033 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GJB2P29033 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GJB2P29033 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GJB2P29033 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GJB2P29033 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GJB2P29033 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GJB2P29033 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GJB2P29033 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GJB2P29033 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GJB2P29033 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GJB2P29033 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GJB2P29033 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GJB2P29033 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GJB2P29033 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GJB2P29033 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
GJB2P29033 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GJB2P29033 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GJB2P29033 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GJB2P29033 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GJB2P29033 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GJB2P29033 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GJB2P29033 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
GJB2P29033 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GJB2P29033 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
GJB2P29033 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GJB2P29033 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GJB2P29033 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GJB2P29033 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GJB2P29033 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
GJB2P29033 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GJB2P29033 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GJB2P29033 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJB2P29033 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GJB2P29033 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJB2P29033 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJB2P29033 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GJB2P29033 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GJB2P29033 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GJB2P29033 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
GJB2P29033 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GJB2P29033 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GJB2P29033 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GJB2P29033 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GJB2P29033 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GJB2P29033 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GJB2P29033 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GJB2P29033 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GJB2P29033 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GJB2P29033 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GJB2P29033 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GJB2P29033 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GJB2P29033 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GJB2P29033 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
GJB2P29033 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GJB2P29033 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GJB2P29033 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJB2P29033 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJB2P29033 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJB2P29033 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJB2P29033 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJB2P29033 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJB2P29033 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJB2P29033 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJB2P29033 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJB2P29033 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJB2P29033 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJB2P29033 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
GJB2P29033 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GJB2P29033 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GJB2P29033 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GJB2P29033 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GJB2P29033 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJB2P29033 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJB2P29033 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GJB2P29033 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GJB2P29033 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GJB2P29033 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GJB2P29033 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJB2P29033 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GJB2P29033 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GJB2P29033 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms