Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC5P28715 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC5P28715 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERCC5P28715 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC5P28715 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC5P28715 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERCC5P28715 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC5P28715 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC5P28715 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC5P28715 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC5P28715 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC5P28715 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERCC5P28715 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERCC5P28715 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC5P28715 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERCC5P28715 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC5P28715 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC5P28715 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC5P28715 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC5P28715 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC5P28715 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC5P28715 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC5P28715 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC5P28715 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC5P28715 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ERCC5P28715 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ERCC5P28715 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC5P28715 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC5P28715 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC5P28715 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC5P28715 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC5P28715 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC5P28715 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC5P28715 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC5P28715 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC5P28715 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC5P28715 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC5P28715 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC5P28715 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ERCC5P28715 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC5P28715 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC5P28715 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC5P28715 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC5P28715 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC5P28715 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC5P28715 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC5P28715 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC5P28715 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC5P28715 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC5P28715 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC5P28715 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC5P28715 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC5P28715 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC5P28715 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC5P28715 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC5P28715 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC5P28715 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC5P28715 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC5P28715 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC5P28715 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ERCC5P28715 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ERCC5P28715 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC5P28715 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC5P28715 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC5P28715 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC5P28715 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC5P28715 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC5P28715 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC5P28715 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC5P28715 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC5P28715 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC5P28715 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC5P28715 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC5P28715 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC5P28715 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC5P28715 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC5P28715 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC5P28715 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC5P28715 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC5P28715 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC5P28715 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC5P28715 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC5P28715 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC5P28715 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC5P28715 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC5P28715 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC5P28715 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC5P28715 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC5P28715 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ERCC5P28715 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC5P28715 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC5P28715 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC5P28715 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC5P28715 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC5P28715 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC5P28715 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC5P28715 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC5P28715 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC5P28715 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC5P28715 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms