Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IL3RAP26951 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL3RAP26951 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IL3RAP26951 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IL3RAP26951 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IL3RAP26951 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IL3RAP26951 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IL3RAP26951 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IL3RAP26951 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IL3RAP26951 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IL3RAP26951 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IL3RAP26951 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IL3RAP26951 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IL3RAP26951 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL3RAP26951 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL3RAP26951 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL3RAP26951 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL3RAP26951 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL3RAP26951 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IL3RAP26951 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IL3RAP26951 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IL3RAP26951 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
IL3RAP26951 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IL3RAP26951 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IL3RAP26951 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IL3RAP26951 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
IL3RAP26951 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IL3RAP26951 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IL3RAP26951 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IL3RAP26951 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IL3RAP26951 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IL3RAP26951 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IL3RAP26951 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IL3RAP26951 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IL3RAP26951 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IL3RAP26951 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IL3RAP26951 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IL3RAP26951 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IL3RAP26951 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IL3RAP26951 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IL3RAP26951 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IL3RAP26951 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IL3RAP26951 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IL3RAP26951 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IL3RAP26951 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IL3RAP26951 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms