Protein–RNA interactions for Protein: P23975

SLC6A2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A2P23975 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A2P23975 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC6A2P23975 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A2P23975 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A2P23975 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A2P23975 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A2P23975 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A2P23975 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A2P23975 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A2P23975 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A2P23975 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A2P23975 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A2P23975 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC6A2P23975 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC6A2P23975 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A2P23975 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A2P23975 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC6A2P23975 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC6A2P23975 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC6A2P23975 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC6A2P23975 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC6A2P23975 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A2P23975 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A2P23975 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A2P23975 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A2P23975 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A2P23975 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A2P23975 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC6A2P23975 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A2P23975 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A2P23975 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A2P23975 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A2P23975 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A2P23975 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A2P23975 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A2P23975 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A2P23975 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms