Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRM1P23921 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRM1P23921 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RRM1P23921 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RRM1P23921 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RRM1P23921 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRM1P23921 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRM1P23921 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRM1P23921 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRM1P23921 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RRM1P23921 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRM1P23921 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRM1P23921 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRM1P23921 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRM1P23921 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRM1P23921 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRM1P23921 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRM1P23921 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRM1P23921 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRM1P23921 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRM1P23921 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRM1P23921 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRM1P23921 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRM1P23921 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRM1P23921 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRM1P23921 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRM1P23921 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRM1P23921 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRM1P23921 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRM1P23921 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRM1P23921 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRM1P23921 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRM1P23921 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRM1P23921 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRM1P23921 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRM1P23921 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRM1P23921 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRM1P23921 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRM1P23921 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRM1P23921 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRM1P23921 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRM1P23921 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRM1P23921 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRM1P23921 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRM1P23921 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRM1P23921 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRM1P23921 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RRM1P23921 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRM1P23921 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRM1P23921 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRM1P23921 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRM1P23921 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RRM1P23921 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRM1P23921 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRM1P23921 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRM1P23921 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRM1P23921 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRM1P23921 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRM1P23921 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRM1P23921 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRM1P23921 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RRM1P23921 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRM1P23921 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRM1P23921 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRM1P23921 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRM1P23921 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRM1P23921 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRM1P23921 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRM1P23921 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRM1P23921 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRM1P23921 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRM1P23921 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRM1P23921 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRM1P23921 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRM1P23921 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRM1P23921 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRM1P23921 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRM1P23921 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RRM1P23921 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RRM1P23921 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRM1P23921 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRM1P23921 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRM1P23921 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRM1P23921 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRM1P23921 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRM1P23921 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RRM1P23921 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RRM1P23921 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRM1P23921 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RRM1P23921 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRM1P23921 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRM1P23921 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRM1P23921 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RRM1P23921 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RRM1P23921 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRM1P23921 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRM1P23921 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RRM1P23921 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRM1P23921 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRM1P23921 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms