Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLDCP23378 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLDCP23378 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLDCP23378 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLDCP23378 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GLDCP23378 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GLDCP23378 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GLDCP23378 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GLDCP23378 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GLDCP23378 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GLDCP23378 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLDCP23378 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLDCP23378 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLDCP23378 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLDCP23378 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLDCP23378 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GLDCP23378 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLDCP23378 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLDCP23378 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GLDCP23378 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GLDCP23378 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GLDCP23378 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GLDCP23378 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GLDCP23378 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GLDCP23378 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLDCP23378 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLDCP23378 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLDCP23378 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLDCP23378 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLDCP23378 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GLDCP23378 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GLDCP23378 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GLDCP23378 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GLDCP23378 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GLDCP23378 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLDCP23378 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLDCP23378 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GLDCP23378 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLDCP23378 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLDCP23378 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLDCP23378 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLDCP23378 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLDCP23378 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLDCP23378 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLDCP23378 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLDCP23378 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLDCP23378 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GLDCP23378 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLDCP23378 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLDCP23378 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GLDCP23378 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GLDCP23378 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLDCP23378 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLDCP23378 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLDCP23378 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLDCP23378 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLDCP23378 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLDCP23378 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLDCP23378 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLDCP23378 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLDCP23378 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLDCP23378 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLDCP23378 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLDCP23378 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLDCP23378 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLDCP23378 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLDCP23378 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLDCP23378 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLDCP23378 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLDCP23378 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLDCP23378 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GLDCP23378 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLDCP23378 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLDCP23378 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GLDCP23378 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLDCP23378 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLDCP23378 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLDCP23378 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLDCP23378 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLDCP23378 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLDCP23378 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLDCP23378 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GLDCP23378 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLDCP23378 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLDCP23378 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GLDCP23378 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GLDCP23378 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLDCP23378 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLDCP23378 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GLDCP23378 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GLDCP23378 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GLDCP23378 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GLDCP23378 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLDCP23378 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GLDCP23378 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GLDCP23378 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GLDCP23378 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GLDCP23378 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GLDCP23378 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GLDCP23378 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms