Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNA5P22460 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNA5P22460 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNA5P22460 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNA5P22460 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNA5P22460 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNA5P22460 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNA5P22460 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNA5P22460 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KCNA5P22460 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNA5P22460 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNA5P22460 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNA5P22460 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNA5P22460 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNA5P22460 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNA5P22460 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNA5P22460 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNA5P22460 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNA5P22460 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNA5P22460 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNA5P22460 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNA5P22460 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNA5P22460 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNA5P22460 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNA5P22460 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNA5P22460 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNA5P22460 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNA5P22460 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNA5P22460 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNA5P22460 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNA5P22460 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNA5P22460 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA5P22460 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA5P22460 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA5P22460 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA5P22460 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA5P22460 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNA5P22460 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA5P22460 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA5P22460 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA5P22460 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA5P22460 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA5P22460 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA5P22460 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA5P22460 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNA5P22460 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNA5P22460 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNA5P22460 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNA5P22460 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNA5P22460 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNA5P22460 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNA5P22460 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNA5P22460 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNA5P22460 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNA5P22460 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNA5P22460 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNA5P22460 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNA5P22460 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNA5P22460 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNA5P22460 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNA5P22460 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNA5P22460 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNA5P22460 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNA5P22460 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNA5P22460 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNA5P22460 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNA5P22460 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNA5P22460 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNA5P22460 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNA5P22460 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNA5P22460 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNA5P22460 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNA5P22460 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNA5P22460 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNA5P22460 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNA5P22460 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNA5P22460 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNA5P22460 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNA5P22460 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNA5P22460 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNA5P22460 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNA5P22460 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNA5P22460 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA5P22460 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA5P22460 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA5P22460 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA5P22460 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA5P22460 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNA5P22460 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA5P22460 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA5P22460 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA5P22460 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA5P22460 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNA5P22460 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNA5P22460 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA5P22460 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA5P22460 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA5P22460 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA5P22460 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNA5P22460 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms