Protein–RNA interactions for Protein: P21912

SDHB, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHBP21912 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDHBP21912 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDHBP21912 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDHBP21912 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDHBP21912 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDHBP21912 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDHBP21912 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDHBP21912 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDHBP21912 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDHBP21912 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDHBP21912 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDHBP21912 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDHBP21912 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDHBP21912 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDHBP21912 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDHBP21912 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDHBP21912 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDHBP21912 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDHBP21912 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDHBP21912 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDHBP21912 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDHBP21912 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDHBP21912 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDHBP21912 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDHBP21912 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDHBP21912 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDHBP21912 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDHBP21912 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDHBP21912 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDHBP21912 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDHBP21912 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SDHBP21912 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDHBP21912 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDHBP21912 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDHBP21912 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDHBP21912 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDHBP21912 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDHBP21912 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDHBP21912 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDHBP21912 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDHBP21912 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDHBP21912 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDHBP21912 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDHBP21912 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SDHBP21912 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SDHBP21912 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SDHBP21912 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDHBP21912 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDHBP21912 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDHBP21912 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SDHBP21912 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDHBP21912 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDHBP21912 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDHBP21912 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDHBP21912 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDHBP21912 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDHBP21912 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDHBP21912 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDHBP21912 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SDHBP21912 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDHBP21912 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDHBP21912 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDHBP21912 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDHBP21912 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDHBP21912 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDHBP21912 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDHBP21912 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDHBP21912 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDHBP21912 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDHBP21912 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDHBP21912 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDHBP21912 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDHBP21912 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDHBP21912 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDHBP21912 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDHBP21912 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SDHBP21912 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDHBP21912 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDHBP21912 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDHBP21912 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDHBP21912 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDHBP21912 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDHBP21912 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SDHBP21912 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDHBP21912 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDHBP21912 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDHBP21912 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDHBP21912 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SDHBP21912 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDHBP21912 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDHBP21912 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDHBP21912 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDHBP21912 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDHBP21912 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDHBP21912 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDHBP21912 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDHBP21912 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDHBP21912 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDHBP21912 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDHBP21912 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms