Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA2P17301 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA2P17301 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGA2P17301 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGA2P17301 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA2P17301 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA2P17301 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA2P17301 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA2P17301 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA2P17301 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA2P17301 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA2P17301 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA2P17301 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA2P17301 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA2P17301 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA2P17301 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA2P17301 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA2P17301 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA2P17301 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA2P17301 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA2P17301 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA2P17301 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA2P17301 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA2P17301 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA2P17301 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA2P17301 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA2P17301 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA2P17301 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA2P17301 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA2P17301 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA2P17301 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA2P17301 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA2P17301 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA2P17301 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA2P17301 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGA2P17301 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA2P17301 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA2P17301 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA2P17301 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA2P17301 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA2P17301 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA2P17301 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA2P17301 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA2P17301 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms