Protein–RNA interactions for Protein: P17050

NAGA, Alpha-N-acetylgalactosaminidase, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGAP17050 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAGAP17050 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAGAP17050 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAGAP17050 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAGAP17050 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAGAP17050 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAGAP17050 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAGAP17050 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAGAP17050 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NAGAP17050 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAGAP17050 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAGAP17050 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAGAP17050 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAGAP17050 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAGAP17050 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAGAP17050 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAGAP17050 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAGAP17050 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAGAP17050 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAGAP17050 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAGAP17050 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAGAP17050 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAGAP17050 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAGAP17050 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAGAP17050 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAGAP17050 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAGAP17050 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAGAP17050 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAGAP17050 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAGAP17050 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAGAP17050 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAGAP17050 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAGAP17050 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAGAP17050 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAGAP17050 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NAGAP17050 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAGAP17050 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAGAP17050 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NAGAP17050 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NAGAP17050 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NAGAP17050 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NAGAP17050 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NAGAP17050 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NAGAP17050 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAGAP17050 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NAGAP17050 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAGAP17050 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAGAP17050 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAGAP17050 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAGAP17050 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAGAP17050 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAGAP17050 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAGAP17050 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAGAP17050 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAGAP17050 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NAGAP17050 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NAGAP17050 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NAGAP17050 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAGAP17050 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAGAP17050 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAGAP17050 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAGAP17050 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAGAP17050 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAGAP17050 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAGAP17050 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAGAP17050 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAGAP17050 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NAGAP17050 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAGAP17050 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAGAP17050 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAGAP17050 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAGAP17050 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAGAP17050 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAGAP17050 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAGAP17050 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAGAP17050 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAGAP17050 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAGAP17050 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NAGAP17050 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NAGAP17050 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAGAP17050 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAGAP17050 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAGAP17050 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAGAP17050 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAGAP17050 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAGAP17050 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAGAP17050 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAGAP17050 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAGAP17050 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAGAP17050 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NAGAP17050 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAGAP17050 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAGAP17050 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAGAP17050 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAGAP17050 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAGAP17050 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAGAP17050 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAGAP17050 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAGAP17050 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NAGAP17050 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms