Protein–RNA interactions for Protein: P15622

ZNF250, Zinc finger protein 250, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF250P15622 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF250P15622 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF250P15622 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF250P15622 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF250P15622 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF250P15622 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF250P15622 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF250P15622 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF250P15622 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF250P15622 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF250P15622 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF250P15622 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF250P15622 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF250P15622 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF250P15622 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF250P15622 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF250P15622 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF250P15622 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF250P15622 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF250P15622 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF250P15622 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF250P15622 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF250P15622 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF250P15622 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF250P15622 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF250P15622 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF250P15622 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF250P15622 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF250P15622 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF250P15622 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF250P15622 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF250P15622 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF250P15622 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF250P15622 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF250P15622 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF250P15622 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF250P15622 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF250P15622 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF250P15622 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF250P15622 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF250P15622 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF250P15622 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF250P15622 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF250P15622 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms