Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPA3P15088 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPA3P15088 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPA3P15088 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPA3P15088 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPA3P15088 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPA3P15088 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPA3P15088 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPA3P15088 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPA3P15088 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPA3P15088 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPA3P15088 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPA3P15088 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CPA3P15088 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPA3P15088 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPA3P15088 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPA3P15088 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPA3P15088 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CPA3P15088 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPA3P15088 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPA3P15088 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPA3P15088 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPA3P15088 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA3P15088 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA3P15088 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA3P15088 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA3P15088 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA3P15088 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA3P15088 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA3P15088 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA3P15088 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA3P15088 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA3P15088 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA3P15088 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPA3P15088 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPA3P15088 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPA3P15088 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA3P15088 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA3P15088 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA3P15088 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA3P15088 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA3P15088 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA3P15088 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA3P15088 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA3P15088 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA3P15088 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA3P15088 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPA3P15088 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPA3P15088 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPA3P15088 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPA3P15088 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPA3P15088 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPA3P15088 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPA3P15088 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPA3P15088 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPA3P15088 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPA3P15088 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPA3P15088 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPA3P15088 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPA3P15088 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPA3P15088 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPA3P15088 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CPA3P15088 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPA3P15088 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPA3P15088 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPA3P15088 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPA3P15088 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPA3P15088 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPA3P15088 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA3P15088 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA3P15088 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPA3P15088 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA3P15088 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA3P15088 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPA3P15088 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA3P15088 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA3P15088 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPA3P15088 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPA3P15088 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPA3P15088 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA3P15088 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA3P15088 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA3P15088 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA3P15088 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA3P15088 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA3P15088 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA3P15088 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA3P15088 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA3P15088 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA3P15088 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA3P15088 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPA3P15088 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPA3P15088 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPA3P15088 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPA3P15088 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CPA3P15088 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA3P15088 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA3P15088 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA3P15088 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA3P15088 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms