Protein–RNA interactions for Protein: P13497

BMP1, Bone morphogenetic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP1P13497 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BMP1P13497 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BMP1P13497 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BMP1P13497 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BMP1P13497 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BMP1P13497 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BMP1P13497 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BMP1P13497 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
BMP1P13497 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BMP1P13497 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BMP1P13497 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BMP1P13497 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BMP1P13497 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BMP1P13497 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BMP1P13497 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BMP1P13497 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BMP1P13497 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
BMP1P13497 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BMP1P13497 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BMP1P13497 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BMP1P13497 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BMP1P13497 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BMP1P13497 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BMP1P13497 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BMP1P13497 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BMP1P13497 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BMP1P13497 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BMP1P13497 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BMP1P13497 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BMP1P13497 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BMP1P13497 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BMP1P13497 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BMP1P13497 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BMP1P13497 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BMP1P13497 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BMP1P13497 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BMP1P13497 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BMP1P13497 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BMP1P13497 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BMP1P13497 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BMP1P13497 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BMP1P13497 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BMP1P13497 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BMP1P13497 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BMP1P13497 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BMP1P13497 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BMP1P13497 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BMP1P13497 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BMP1P13497 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BMP1P13497 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BMP1P13497 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BMP1P13497 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BMP1P13497 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BMP1P13497 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BMP1P13497 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BMP1P13497 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BMP1P13497 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BMP1P13497 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BMP1P13497 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BMP1P13497 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BMP1P13497 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BMP1P13497 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BMP1P13497 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BMP1P13497 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BMP1P13497 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BMP1P13497 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BMP1P13497 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BMP1P13497 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BMP1P13497 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BMP1P13497 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BMP1P13497 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BMP1P13497 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BMP1P13497 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BMP1P13497 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BMP1P13497 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BMP1P13497 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BMP1P13497 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BMP1P13497 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BMP1P13497 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BMP1P13497 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BMP1P13497 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BMP1P13497 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BMP1P13497 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BMP1P13497 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BMP1P13497 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BMP1P13497 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BMP1P13497 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BMP1P13497 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BMP1P13497 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BMP1P13497 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BMP1P13497 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BMP1P13497 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BMP1P13497 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BMP1P13497 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BMP1P13497 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BMP1P13497 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BMP1P13497 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BMP1P13497 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BMP1P13497 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BMP1P13497 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms