Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EPB41P11171 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EPB41P11171 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EPB41P11171 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EPB41P11171 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EPB41P11171 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EPB41P11171 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EPB41P11171 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EPB41P11171 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EPB41P11171 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EPB41P11171 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EPB41P11171 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EPB41P11171 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EPB41P11171 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EPB41P11171 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EPB41P11171 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EPB41P11171 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EPB41P11171 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EPB41P11171 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EPB41P11171 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EPB41P11171 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EPB41P11171 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EPB41P11171 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EPB41P11171 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EPB41P11171 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EPB41P11171 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EPB41P11171 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EPB41P11171 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPB41P11171 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPB41P11171 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPB41P11171 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPB41P11171 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPB41P11171 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EPB41P11171 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EPB41P11171 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EPB41P11171 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EPB41P11171 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EPB41P11171 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EPB41P11171 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EPB41P11171 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EPB41P11171 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EPB41P11171 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EPB41P11171 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EPB41P11171 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EPB41P11171 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EPB41P11171 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EPB41P11171 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EPB41P11171 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EPB41P11171 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EPB41P11171 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EPB41P11171 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EPB41P11171 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EPB41P11171 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EPB41P11171 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EPB41P11171 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EPB41P11171 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EPB41P11171 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EPB41P11171 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EPB41P11171 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EPB41P11171 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EPB41P11171 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EPB41P11171 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
EPB41P11171 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EPB41P11171 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EPB41P11171 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EPB41P11171 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EPB41P11171 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EPB41P11171 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EPB41P11171 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EPB41P11171 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EPB41P11171 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EPB41P11171 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
EPB41P11171 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EPB41P11171 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EPB41P11171 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EPB41P11171 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EPB41P11171 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EPB41P11171 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EPB41P11171 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EPB41P11171 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EPB41P11171 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EPB41P11171 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EPB41P11171 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EPB41P11171 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EPB41P11171 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EPB41P11171 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EPB41P11171 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
EPB41P11171 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EPB41P11171 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EPB41P11171 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPB41P11171 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPB41P11171 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPB41P11171 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPB41P11171 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPB41P11171 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPB41P11171 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPB41P11171 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPB41P11171 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPB41P11171 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EPB41P11171 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms