Protein–RNA interactions for Protein: P0DP72

VSIG10L2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10L2P0DP72 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSIG10L2P0DP72 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSIG10L2P0DP72 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSIG10L2P0DP72 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSIG10L2P0DP72 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSIG10L2P0DP72 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG10L2P0DP72 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG10L2P0DP72 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG10L2P0DP72 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG10L2P0DP72 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG10L2P0DP72 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG10L2P0DP72 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG10L2P0DP72 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10L2P0DP72 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10L2P0DP72 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10L2P0DP72 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10L2P0DP72 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG10L2P0DP72 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSIG10L2P0DP72 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSIG10L2P0DP72 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VSIG10L2P0DP72 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSIG10L2P0DP72 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VSIG10L2P0DP72 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG10L2P0DP72 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10L2P0DP72 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10L2P0DP72 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10L2P0DP72 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10L2P0DP72 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10L2P0DP72 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10L2P0DP72 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10L2P0DP72 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10L2P0DP72 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VSIG10L2P0DP72 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10L2P0DP72 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10L2P0DP72 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG10L2P0DP72 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG10L2P0DP72 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10L2P0DP72 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10L2P0DP72 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10L2P0DP72 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10L2P0DP72 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10L2P0DP72 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10L2P0DP72 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10L2P0DP72 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10L2P0DP72 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10L2P0DP72 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10L2P0DP72 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10L2P0DP72 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10L2P0DP72 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSIG10L2P0DP72 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSIG10L2P0DP72 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSIG10L2P0DP72 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VSIG10L2P0DP72 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSIG10L2P0DP72 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSIG10L2P0DP72 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSIG10L2P0DP72 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10L2P0DP72 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG10L2P0DP72 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10L2P0DP72 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG10L2P0DP72 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10L2P0DP72 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10L2P0DP72 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10L2P0DP72 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10L2P0DP72 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG10L2P0DP72 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10L2P0DP72 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10L2P0DP72 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10L2P0DP72 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10L2P0DP72 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSIG10L2P0DP72 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10L2P0DP72 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10L2P0DP72 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10L2P0DP72 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10L2P0DP72 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10L2P0DP72 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10L2P0DP72 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms