Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RD3LP0DJH9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RD3LP0DJH9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RD3LP0DJH9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RD3LP0DJH9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RD3LP0DJH9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RD3LP0DJH9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RD3LP0DJH9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RD3LP0DJH9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RD3LP0DJH9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RD3LP0DJH9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RD3LP0DJH9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RD3LP0DJH9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3LP0DJH9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3LP0DJH9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3LP0DJH9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3LP0DJH9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RD3LP0DJH9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms