Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M7

ACSM4, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM4P0C7M7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSM4P0C7M7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSM4P0C7M7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSM4P0C7M7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACSM4P0C7M7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSM4P0C7M7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSM4P0C7M7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSM4P0C7M7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSM4P0C7M7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSM4P0C7M7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSM4P0C7M7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSM4P0C7M7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSM4P0C7M7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSM4P0C7M7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSM4P0C7M7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSM4P0C7M7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSM4P0C7M7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSM4P0C7M7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSM4P0C7M7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSM4P0C7M7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSM4P0C7M7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSM4P0C7M7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSM4P0C7M7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms